APOPTOZĖJE DALYVAUJANČIŲ TP53 IR BBC3 GENŲ FUNKCINIŲ POLIMORFIZMŲ PROGNOSTINĖ VERTĖ SERGANT ANKSTYVU KRŪTIES VĖŽIU

Ištrauka

APOPTOZĖJE DALYVAUJANČIŲ TP53 IR BBC3 GENŲ FUNKCINIŲ POLIMORFIZMŲ PROGNOSTINĖ VERTĖ SERGANT ANKSTYVU KRŪTIES VĖŽIU
MAGISTRINIS BAIGIAMASIS DARBAS

TURINYS
SANTRAUKA 4
SUMMARY 6
PADĖKA 8
INTERESŲ KONFLIKTAS 8
ETIKOS KOMITETO LEIDIMAS 8
SANTRUMPOS 9
SĄVOKOS 10
ĮVADAS 11
DARBO TIKSLAS IR UŽDAVINIAI 12
LITERATŪROS APŽVALGA 13
Krūties vėžio problema, prognozės veiksniai 13
Apoptozės reikšmė krūties vėžio vystymuisi ir prognozei 14
TP53 geno ir koduojamo baltymo vaidmuo pacientėms, sergančioms krūties vėžiu 18
BBC3 geno ir koduojamo baltymo vaidmuo krūties vėžio patogenezėje 21
TYRIMO METODIKA 24
Tyrimo planavimas 24
Tyrimo objektas 24
Tiriamųjų atranka 24
Pacientų ligos sekimas tyrimo metu 30
Duomenų analizės metodai 30
REZULTATAI 31
1. Tiriamosios imties apibūdinimas bei BBC3 rs2032809 ir TP53 rs1042522 polimorfizmų pasiskirstymas
tiriamųjų grupėje 31
2. BBC3 rs2032809ir TP53 rs1042522 polimorfizmų sąsajos su klinikinėmis bei morfologinėmis naviko 
savybėmis 32
3. BBC3 rs2032809 ir TP53 rs1042522 polimorfizmų sąsajos su išgyvenamumu 37
REZULTATŲ APTARIMAS 44
Rezultatų, gautų tiriant TP53 rs1042522 polimorfizmą, aptarimas 44
Rezultatų, gautų tiriant BBC3 rs2032809 polimorfizmą, aptarimas 46
IŠVADOS 49
PRAKTINĖS REKOMENDACIJOS 50
LITERATŪROS SĄRAŠAS 51

ĮVADAS
Pasaulio sveikatos organizacijos duomenimis 2018 metais pasaulyje nustatyta daugiau kaip
2 milijonai naujų KV atvejų ir daugiau kaip 600 tūkstančių mirčių dėl KV. Lietuvoje ir pasaulyje
krūties vėžys yra dažniausia moterų onkologinė liga. Lietuvoje vėžio registro duomenimis KV
sąlygoja virš 500 mirčių per metus (2012 m. duomenys). Šiuo metu vis labiau ieškoma naujų
predikcinių bei prognostinių KV veiksnių, siekiant ne tik individualizuoti pacienčių gydymą, bet ir
pagerinti išgyvenamumą, gyvenimo kokybę.
Šis tyrimas prisideda prie prognostinių KV biologinių žymenų paieškos. Mes pasirinkome
analizuoti ląstelės programuotos mirties (apoptozės) procesuose dalyvaujančių TP53 (angl. tumour
protein p53) ir BBC3 (angl. BCL-2 binding component 3), dar žinomas kaip PUMA (angl. p53
upregulated modulator of apoptosis) genų funkcinius vieno nukleotido polimorfizmus (VNP). Šių
genų koduojami baltymai BBC3 ir TP53 skatina proapoptogeninių veiksnių aktyvinimą, stabdo
apoptozę slopinančius mechanizmus ir taip lemia programuotą ląstelės žūtį. BBC3 ir p53 baltymai
yra svarbūs, vykstant KV karcinogenezės procesams, ir žinomi kaip naviką supresuojantys
veiksniai. Remiantis ankstesnių autorių duomenimis, funkciniai polimorfizmai BBC3 ir TP53
genuose gali sąlygoti mažesnę genų koduojamų baltymų gamybą, kuri ankstesnių tyrimų
duomenimis turi neigiamos įtakos KV eigai. Literatūroje yra pavienių studijų, nagrinėjančių
pasirinktų BBC3 rs2032809 ir TP53 rs1042522 polimorfizmų įtaką krūties vėžio eigai, tačiau jų
rezultatai nevienareikšmiški, dauguma tyrimų buvo mažos imties. Mūsų tyrimas unikalus tuo, kad
pirmą kartą šių polimorfizmų dažnis, įtaka KV prognozei ir jų sąsaja su klinikinėmis bei
morfologinėmis naviko savybėmis vertinama homogeniškoje ankstyvu KV sergančių moterų
grupėje. Manome, kad, atlikę šį tyrimą, galime identifikuoti naujus KV prognostinius biologinius
žymenis, kurie ateityje padėtų individualizuoti ir gerinti ankstyvu KV sergančių pacienčių gydymą.
Tyrimas organizuotas, atsižvelgiant į kitų autorių tyrimuose paskelbtą metodiką. BBC3
rs2032809 ir TP53 rs1042522 polimorfizmai buvo išskirti iš tyrime dalyvavusių pacienčių kraujo
leukocitų. DNR amplifikacija atlikta polimerazės grandininės reakcijos (PGR) metodu, genotipų
vertinimas – PGR – restrikcijos fragmentų ilgio polimorfizmo (PGR–RFIP) metodu, o rezultatų
frakcionavimas atliktas naudojantis elektroforeze. Šio tyrimo tikslas buvo ištirti BBC3 rs2032809 ir
TP53 rs1042522 polimorfizmus ir įvertinti jų sąsajas su klinikinėmis bei morfologinėmis KV
savybėmis bei nustatyti šių polimorfizmų ryšį su ankstyvu KV sergančių pacienčių ligos prognoze.

DARBO TIKSLAS IR UŽDAVINIAI
Tyrimo tikslas
Nustatyti apoptozėje dalyvaujančių p53 ir BBC3 genų polimorfizmus ir jų sąsajas su KV eiga.
Tyrimo uždaviniai
1.Įvertinti p53 ir BBC3 genų polimorfizmų alelių ir genotipų pasiskirstymą tiriamosioms,
sergančioms ankstyvu KV;
2.Išanalizuoti šių polimorfizmų sąsajas su klinikinėmis bei morfologinėmis naviko savybėmis;
3.Nustatyti šių polimorfizmų vertę, prognozuojant ankstyvu KV sergančių pacienčių išgyvenamumą.